ترپسین از جمله آنزیم‌هایی است که در فرآیند‌‌های بیوتکنولوژی کاربرد فراوان دارد.

ترپسین به دلیل خاصیت گوارشی به طور گسترده‌ای برای تفکیک سلولی، کشت سلولی و تفکیک بافت اولیه استفاده می‌شود.

در آزمایشگاه‌های سلولی، طی فرآیند پاساژ سلول‌ها، از تریپسین جهت جدا کردن سلول‌های چسبیده شده به دیواره ظرف کشت سلولی و همچنین جدا کردن سلول‌ها از بافت‌ها استفاده می‌شود.

قابل توجه است که بعد از جدا‌سازی سلول از فلاسک بهتر است که آنزیم تریپسین غیرفعال شود چرا که سبب تجزیه سلول می‌شود.